Par son mode de fabrication, et donc par sa structure. La paraffine est séparée du pétrole brut et présente une distribution de longueurs de chaîne avec une certaine ramification. La cire FT est synthétisée à partir de monoxyde de carbone et d'hydrogène, les chaînes étant construites carbone par carbone, ce qui donne des molécules plus longues, nettement plus linéaires et de distribution plus étroite. Il en résulte une cire plus dure, à point de fusion plus élevé et à teneur en huile plus faible.