Weil es ihre Unterschiede überdeckt. Proteine unterscheiden sich in Form und Nettoladung und lassen sich daher im nativen Zustand nicht allein nach Größe trennen. SDS entfaltet sie und bindet entlang der Kette mit etwa 1,4 Gramm pro Gramm Protein, wodurch jedes Protein eine gleichmäßige, zur Kettenlänge proportionale negative Ladung und eine ähnliche stäbchenförmige Gestalt erhält. Die Mobilität hängt dann nur noch vom Molekulargewicht ab.