Weil sie sich anreichert, wenn dieser Stoffwechselweg gestört ist. Bei einem Mangel an Cobamamid kann Methylmalonyl-CoA nicht umgewandelt werden, und die Methylmalonsäure steigt in Blut und Urin an. Damit ist sie ein spezifischerer Indikator für einen funktionellen B12-Mangel als das Serum-B12 selbst, das normal erscheinen kann, während die Gewebefunktion bereits beeinträchtigt ist.